Publikationer pr. år
Publikationer pr. år
Personlig profil
Expertise
- Next generation sequencing of human pathogenic bacteria
- Microbial Genetics
- Molecular microbiology
- Bioinformatics
- Phylogenetics
- Antimicrobial resistance
- Molecular typing
- Fitness cost
Primære forskningsområder
- Human pathogenic bacteria and antimicrobial resistance in the clinical setting based on Next Generation Sequencing.
- Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae and Enterococcus faecium
- inter- and intraclonal genetic variation
- outbreaks of multidrug resistant pathogens
Aktuel forskning
High troughput sequencing of clinical bacterial isolates with the aim of improving current microbial diagnostics. Outbreak detection and analyses. Adaptation of human pathogenic bacteria and antimicrobial resistance in the clinical setting.
Mulige interessekonflikter
none
Fingeraftryk
Dyk ned i forskningsemnerne, hvor Karen Leth Nielsen er aktive. Disse emneetiketter kommer fra denne persons arbejder. Sammen danner de et unikt fingerprint.
- 1 Lignende profiler
Samarbejde og topforskningsområder i de sidste fem år
Seneste eksterne samarbejde på lande-/områdeniveau. Dyk ned i detaljerne ved at klikke på prikkerne eller
-
Chromosomal genes modulating fosfomycin susceptibility in uropathogenic Escherichia coli: a genome-wide analysis
Ma, Y., Pirolo, M., Giarratana, L., Leth Nielsen, K., Häussler, S. & Guardabassi, L., 2 apr. 2025, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 69, 4, s. e0141724Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Genomic epidemiology of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in Eastern Denmark from 2020 to 2022, and identification of vanB Tn1549 insertion sites
Knudsen, M. J. S., Castruita, J. A. S., Rubin, I. M. C., Mollerup, S., Johansen, H. K., Marvig, R. L., Nielsen, K. L., Holzknecht, B. J., Hoppe, M., Kemp, M., Westh, H. & Pinholt, M., 1 apr. 2025, (E-pub ahead of print) I: European journal of clinical microbiology & infectious diseases : official publication of the European Society of Clinical Microbiology.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
rpoB mutations and their association with rifampicin resistance in clinical Staphylococcus epidermidis
Edslev, S. M., Aarris, M., Nielsen, K. L., Hertz, F. B., Johannesen, T. B., Kolenda, C., Laurent, F., Månsson, E., Söderquist, B. & Stegger, M., 6 feb. 2025, (E-pub ahead of print) I: The Journal of antimicrobial chemotherapy. 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
The antimycotic 5-fluorocytosine is a virulence inhibitor of uropathogenic Escherichia coli and eradicates biofilm-embedded bacteria synergizing with β-lactams
Ravishankar, S., Conte, A. L., Carrasco Aliaga, S. J., Baldelli, V., Nielsen, K. L., Paroni, M., Conte, M. P., Landini, P. & Rossi, E., 3 apr. 2025, (E-pub ahead of print) I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. s. e0028025Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Comparison of morbidity and mortality after bloodstream infection with vancomycin-resistant versus -susceptible Enterococcus faecium: A nationwide cohort study in Denmark, 2010-2019
Bager, P., Kähler, J., Andersson, M., Holzknecht, B. J., Kjær Hansen, S. G., Schønning, K., Nielsen, K. L., Koch, K., Pinholt, M., Voldstedlund, M., Larsen, A. R., Kristensen, B., Mølbak, K., Sönksen, U. W., Skovgaard, S., Skov, R. & Hammerum, A. M., 2024, I: Emerging microbes & infections. 13, 1, 2309969.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
5 Citationer (Scopus)